The Persistome: Genome-Wide Investigations of Airway Populations of pseuddomonas aeruginosa in cystisc fibrosis patients

Igennem de sidste er der år har jeg indsamlet de initiale og efterfølgende P. aeruginosa bakterier fra lungerne og efterfølgende også fra bihulerne fra børn og unge med CF. I 500 af disse isolater har vi fået bestemt alle arveanlæg ved fuld genomsekventering.

Formålet med projektet er at se om der er en sammenhæng med den antibiotika behandling der er givet til patienterne og de ændringer (mutationer) der sker i bakteriernes arveanlæg. Desuden fokuserer vi i projektet på de ændringer der sker i bakterierne i forbindelse med tilpasning til livet i lungerne dels i forbindelse med kolonisering og efterfølgende ved etablering af den kroniske lunge infektion. På længere sigt er det vores mål ved genundersøgelser rutinemæssigt at kunne forudse hvilke mutationer der skal til for at etablere sig kronisk i lungerne hos FC patienterne, og når disse ændringer forekommer sætte ind med særlig intensiv antibiotisk behandling til netop disse patienter.