Støttede projekter 2014

Her kan du læse om de forskningsprojekter, som har modtaget støtte fra Cystisk Fibrose Foreningen i 2014.

Herunder på siden kan du læse om følgende forskningsprojekter:

  1. Clinical outcomes of children with cystic fibrosis treated with intravenous tobramycin based on a pharmacokinetic assesment
  2. Physiological levels of nitrate support anaerobic growth of Pseudomonas aeruginosa by denitrification at growth rates reported in cystic fibrosis sputum
  3. Bactericidal activity of colistin against Pseudomonas aeruginosa biofilms is independent of hydroxyl radical formation
  4. The genetic basis of Pseudomonas aeruginosa pathoadaptation to the airways of cystic fibrosis patients
  5. Investigation of the RetS-GacAS regulatory network in clinical P. aeruginosa isolates reveals evolutionary adaptation
  6. Genome changes leading to persistence of Pseudomonas aeruginosa in the airways of CF patients
  7. Development of tolerance to antibiotics in Pseudomonas aeruginosa populations in the lungs of cystic fibrosis patients
  8. Rethinking Pseudomonas aeruginosa lung infection: using molecular microbiology Rather than culture and antibodies
  9. Significance of oxygen depletion in chronic lung infections in cystic fibrosis patients
  10. Anti-Pseudomonas aeruginosa IgY antibodies promote bacterial clearance in a murine pneumonia model
  11. A rapid biofilm antimicrobial susceptibility assay under 24 hours for cystic fibrosis patients with P. aeruginosa lung infection
  12. Distribution of Tobramycin and the Impact on Bacterial Killing in a biofilm model
  13. Physiological levels of nitrate support anaerobic growth of Pseudomonas aeruginosa at growth rates reported from cystic fibrosis sputum
  14. Multicenter prevalence study of nontuberculous mycobacteria in patients with cystic fibrosis in Scandinavia
  15. Lung Clearance index and Aspergillus colonization are clinical markers of chronic lung changes by spirometry controlled CT in children with Cystic Fibrosis
  16. Day-time variability and short term effect of chest physiotherapy on multiple breath nitrogen washout in children with cystic fibrosis
  17. Can lung function predict exercise capacity in patients with CF?
  18. Genome sequence of the Danish epidemic strain of Achromobacter ruhlandii
  19. Outpatient parenteral antimicrobial therapy (OPAT) in patients with cystic fibrosis

 

Clinical outcomes of children with cystic fibrosis treated with intravenous tobramycin based on a pharmacokinetic assesment

Af Karen Abrahamsen et al.
Stud.med., Københavns Universitet, Center For Excellence in Pulmonary Biology, Stanford University, California Pacific Medical Center Research Institute, Dansk BørneLunge Center Rigshospitalet, Klinisk Mikrobiologisk Afdeling, Rigshospitalet, Københavns Universitet, Danmark
Abstract, poster presentation, 28th North American Cystsic Fibrosis Conference

Gentagne lungeinfektioner er et stort problem hos patienter med cystisk fibrose. På Lucile Packard Children’s Hospital Stanford (LPCH) består standardbehandlingen for lungeinfektioner med bakterien pseudomonas aeruginosa af en antibiotisk kombinationsbehandling med aminoglykosider og beta-laktam. Den optimale dosering af aminoglykosider i behandlingen af disse patienter er stadig ikke klarlagt.

Dette studie tager udgangspunkt farmakokinetik, der beskriver et lægemiddels optagelse, metabolisme, fordeling og udskillelse i et individ. Studiet undersøger om det ved at benytte en algoritme, hvor dosis tilpasses det enkelte barns farmakokinetik, er muligt at komme den optimale dosering af aminoglykosider nærmere. De cystisk fibrose børn som deltog i studiet, blev behandlet med aminoglykosidet tobramycin, der blev indgivet intravenøst efter en standardiseret doseringsprotokol.

Det primære resultat af interesse for studiet var ændring i patienternes lungefunktion beskrevet som forceret ekspiratorisk volumen efter første sekund (FEV1).Lungefunktionen blev som forventet, signifikant bedre efter at børnene havde fået behandling med tobramycin. Studiet viste at tobramycinværdier mellem 10-20 mg/kg og AUC værdier mellem 50-100 ug/mL/time medførte de største forbedringer i lungefunktionen. Dette giver anledning til at udforske området yderligere for at finde specifikke parametre, som kan hjælpe med at forudsige de kliniske resultater hos disse patienter.

Physiological levels of nitrate support anaerobic growth of Pseudomonas aeruginosa by denitrification at growth rates reported in cystic fibrosis sputum

Af Laura Line et al. 
Klinisk Mikrobiologisk Afdeling, Rigshospitalet, Danmark, Institut for International Sundhed, Immunologi og Mikrobiologi, Københavns Universitet 
Abstract, poster presentation, 28th North American Cystsic Fibrosis Conference

Kronisk lungeinfektion med Pseudomonas aeruginosa er den mest alvorlige komplikation ved cystisk fibrose (CF). Infektionen er kendetegnet ved, at P. aeruginosa gror i biofilm i lungeslim, hvor immunforsvaret forårsager iltsvind. I dette studie har vi fundet, at fysiologiske mængder af nitrat gør det muligt for P. aeruginosa at gro uden ilt som i lungerne hos CF patienter. Da vi tidligere har observeret at nitrat bliver omsat ved denitrifikation i inficeret CF sputum, fandt vi, at denitrifikation er aktiveret ved iltmangel og tilsætning af fysiologiske mængder af nitrat samt, at denitrifikation er nødvendig for at P. aeruginosa kan opretholde vækst ved fysiologiske betingelser. Vi har således vist, at denitrifikation bidrager væsentligt til P. aeruginosas vækst i de iltfrie zoner i inficerede CF lunger.

Bactericidal activity of colistin against Pseudomonas aeruginosa biofilms is independent of hydroxyl radical formation

Af Mette Kolpen et al.
M.Sc. i Biologi, Ph.D. studerende, Klinisk Mikrobiologisk Afdeling, Rigshospitalet, København
Institut for International Sundhed, Immunologi og Mikrobiologi, Københavns Universitet
Abstract, poster presentation, 28th North American Cystsic Fibrosis Conference

Colistins bakteridræbende aktivitet mod Pseudomonas aeruginosa bakteriesamfund er uafhængigt af iltradikaler. Kronisk Pseudomonas aeruginosa lungeinfektion hos CF patienter er karakteriseret ved antibiotika-tolerante bakteriesamfund i det iltfrie lungeslim grundet aktive neutrofile leukocytter. Betydningen af ilt for den bakteriedræbende effekt af den mest benyttede antibiotika colistin mod P. aeruginosa bakteriesamfund er ikke undersøgt fuldt ud. Vi har vist, at dannelsen af iltradikaler ikke er involveret i colstindrabet på P. aeruginosa bakteriesamfund. Colstinbehandling på iltfrie voksende bakteriesamfund i lungeslim og bihulerne er derfor berettiget.

The genetic basis of Pseudomonas aeruginosa pathoadaptation to the airways of cystic fibrosis patients

Af Rasmus Lykke Marvig et al. 
Ph.D. studerende, Danmark Tekniske Universitet,Novo Nordisk Foundation Centre for Biosustainability 
Abstract, mundtlig præsentation, 37th European Cystic Fibrosis Conference

Dette studie undersøger hvordan bakterien Pseudomonas aeruginosa genetisk tilpasser sig til livet i lungerne hos patienter med cystisk fibrose. Et overraskende resultat ved studiet har været, at bakterierne tilpasser sig ved at ændre deres arvemasse, så de kan leve af hæmoglobinet fra vores røde blodlegemer. Derudover tilpasser bakterierne sig også behandling med antibiotika ved at udvikle resistens. Den viden der kommer fra studiet er nyttig i bestræbelserne på at udvikle fremtidige behandlingsmetoder mod bakterien, der kan resultere i en mere målrettet og effektiv antibiotikabehandling.

Investigation of the RetS-GacAS regulatory network in clinical P. aeruginosa isolates reveals evolutionary adaptation

Af Mikkel Lindgaard et al.
Ph.D. studerende, Danmark Tekniske Universitet,Novo Nordisk Foundation Centre for Biosustainability 
Abstract, poster præsentation, 37th European Cystic Fibrosis Conference

Ud fra Rigshospitalets samling af isolater af bakterien Pseudomonas aeruginosa fra børnepatienter, har vi opdaget, at en bestemt gruppe bakteriegener synes at være særligt udsatte for mutationer. Disse gener kontrollerer om Pseudomonas udtrykker gener, der er involveret i akut infektion eller kronisk infektion. Mutationerne i disse gener opstår i en bestemt rækkefølge, hvilket tyder på, at Pseudomonas bakterien har en fordel ved at være i akut infektionstilstand på et tidspunkt og i kronisk infektionstilstand på et andet. Ved at undersøge hvordan bakteriens opførsel ændrer sig som følge af disse mutationer, håber vi at kunne forudsige, hvordan bakterien vil opføre sig i luftvejene på et givent tidspunkt og derved kunne tilpasse behandlingen for at modvirke den bedst muligt.

Genome changes leading to persistence of Pseudomonas aeruginosa in the airways of CF patients

Af Lea Mette Madsen et al. 
Ph.D. studerende, Danmark Tekniske Universitet, Institut for Systembiologi, Lyngby
Abstract, poster præsentation, 37th European Cystic Fibrosis Conference

Formålet med dette studie er, at finde genetiske markører, der viser hvornår en pseudomonas infektion udvikler sig fra en intermitterende til en kronisk infektion hos patienter med cystisk fibrose. Studiet viser at gener, der relaterer sig til cellernes overflade, antibiotika resistens og optagelse af jern er væsentlige faktorer. Gener i disse grupper kan være såkaldte kandidater til markør-gener. Når man kender markør-generne, vil man hurtigere og bedre kunne tilrettelægge tidlig behandling for patienterne og dermed øge chance for at forhindre at infektionen bliver kronisk og forhåbentlig øge patienternes livskvalitet og levetiden.

Development of tolerance to antibiotics in Pseudomonas aeruginosa populations in the lungs of cystic fibrosis patients

Af Linda Rojek Jensen et al. 
Ph.D. studerende, Danmarks Tekniske Universitet, Institut for Systembiologi, Lyngby
Abstract, poster præsentation, 37th European Cystic Fibrosis Conference

Dette projekt undersøger hvordan bakterien Pseudomonas aeruginosa udvikler sig når den udsættes for stress ved antibiotika behandling. Projektet har identificeret resistente stammer af bakterierne, som knytter sig til den type antibiotika som patienterne har modtaget. Og projektet har fundet kombinationer af gener der ændre sig i bakterierne (muterer) og som giver anledning til resistensudvikling.

Rethinking Pseudomonas aeruginosa lung infection: using molecular microbiology Rather than culture and antibodies

Af Helle Krogh Johansen et al. 
Overlæge, Dr. Med., Klinisk Mikrobiologisk Afdeling, Rigshospitalet, København og Novo Nordisk Foundation Centre for Biosustainability, Hørsholm
Abstract, mundtlig præsentation, 37th European Cystic Fibrosis Conference

Arbejdet med dette projekt er resultat af forskning med de første og efterfølgende Pseudomonas aeruginosa bakterier isolater og deres initiale etablering som lungeinfektionen hos patienter med cystisk fibrose. Ud fra dette søger projektet at redefinere de kliniske definitioner for lungeinfektion med Pseudomas aeruginosa. Den nuværende definition har været benyttet siden midten af 70’erne og bygger på vedvarende positive dyrkninger af bakterierne i patienternes slim fra lungerne og udviklingen af stigende antistoffer mod bakterierne målt i blodet. Projektet benytter genommedicin (biologi) og bakteriedyrkningen (medicin) til at lave en ny og mere direkte definition af Pseudomonas infektion hos patienter med cystisk fibrose.

Significance of oxygen depletion in chronic lung infections in cystic fibrosis patients

Af Mette Kolpen et al.
M.Sc. i Biologi, Ph.D. studerende, Klinisk Mikrobiologisk Afdeling, Rigshospitalet, København
Abstract, poster præsentation, 37th European Cystic Fibrosis Conference

Kronisk Pseudomonas aeruginosa lungeinfektion hos cystisk fibrose patienter er karakteriseret ved tilstedeværelsen af bakteriesamfund omgivet af talrige neutrofile leukocytter (hvide bloglegemer) i iltfri lungeslim. Vi har i et tidligere forskningsprojekt vist, at aktive neutrofile leukocytter danner iltfrie zoner i lungeslimen hos CF patienter, mens Pseudomonas denitrificerer i disse zoner. Dvs at bakterierne kan vokse ved iltfri ånding med NO3-, NO2-, NO, N2O. Komplet denitrifikation involverer afgiftning af NO, hvorved tolerancen mod NO dannet af værten øges.

Vi har undersøgt om evnen til at udføre denitrifikation er relateret til de bakterier der er kendt for at fremkalde sygdom hos patienter med cystisk fibrose. Vi har således sammenlignet bakterierne Pseudomonas aeruginosa, Achromobacter xylosoxidans, Burkholderia multivorans, der er kendt for at forårsage forværret lungefunktion hos patienter med cystisk fibrose mod bakterien S. maltophilia, der ikke fører til en mærkbar forværret lungefunktion. Den manglende evne til at opnå energi ved denitrifikation kan forklare vores fund af sovende og meget langsomt voksende S. maltophilia i CF lungeslim. Den langsomme iltfrie vækst kan forhindre spredning af S. maltophilia i lungerne. Vi foreslår, at evnen til at udføre denitrificering kan bidrage til sygdomsfremkaldelse af bakterierne, da fuldstændig denitrifikation fremmer hurtigere iltfri vækst.

Anti-Pseudomonas aeruginosa IgY antibodies promote bacterial clearance in a murine pneumonia model

Af Kim Thomsen et al. 
Læge, Ph.D. studerende, Klinisk Mikrobiologisk Afdeling, Rigshospitalet, Danmark
Abstract, poster præsentation, 37th European Cystic Fibrosis Conference

Dette forskningsprojekt handler om muligheden for at undgå, at patienter med cystisk fibrose bliver inficeret med bakterien Pseudomonas aerugionosa i lungerne. Projektet har gennemført en række eksperimenter på dyr med såkaldte IgY antistoffer, som er udvundet fra kyllinger. Resultaterne viser, at man kan forbygge Pseudomonas infektion hos dyr med denne antistofbehandling. Dermed kan der være en fremtidig behandling som kan forhindre at patienter med cystisk fibrose bliver inficeret med pseudomonas bakterien i lungerne.Det vil kunne forøge patienterne livskvalitet og levetid.

A rapid biofilm antimicrobial susceptibility assay under 24 hours for cystic fibrosis patients with P. aeruginosa lung infection

Af Wang Hengzhuang et al.
Læge, Ph.D. studerende, Klinisk Mikrobiologisk Afdeling Rigshospitalet, København
Abstract, poster præsentation, 37th European Cystic Fibrosis Conference

Kroniske lungeinfektioner med bakterier der producerer såkaldt biofilm, som eksempelvis Pseudomonas aeruginosa, er den væsentligste årsag til sygdom, ødelæggelse af lungerne og tidlig død for patienter med cystisk fibrose. Metoder der undersøger biofilms følsomhed for behandling med antibiotika er en nyttig måde til at bestemme hvilke antibiotika og hvilke antibiotikakombinationer, der vil være mest succesfulde til at behandle kroniske biofilmsinfektioner. Ved dette projekt er der anvendt en helt ny type undersøgelsesmetode.Tidligere tog sådanne undersøgelser 4-6 dage. Med den nyudviklede metode tager det nu kun 12-24 timer. Dermed er den nye undersøgelsesmetode en god kandidat til hurtigt at finde den rette behandling mod disse biofilmsinfektioner ved cystisk fibrose.

Distribution of Tobramycin and the Impact on Bacterial Killing in a biofilm model

Af Bao Cao et al. 
Læge, Klinisk Mikrobiologisk Afdeling, Rigshospitalet, Danmark
Abstract, poster præsentation, 37th European Cystic Fibrosis Conference

Dette forskningsprojekt studerer en biofilmmodel ved Pseudomonas bakterien. Biofilm er kolonier af bakterier indlejret i en slimet substans, som er særligt svære at behandle trods stadig større forskning og viden på området. Vores studie viser, at når Pseudomas bakterier i biofilm behandlet med antibiotikummet tobramycin, så sker der en god fordeling af stoffet i biofilmmodellen. Efterhånden som biofilmen modnes bliver kolonierne af bakterier større, de lejres perifert i kuglen og de bliver mere modstandsdygtige over for tobramycin. Med flere studier kan vores model bidrage til viden om hvordan behandlingen af biofilminfektioner forbedres.

Physiological levels of nitrate support anaerobic growth of Pseudomonas aeruginosa at growth rates reported from cystic fibrosis sputum

Af Laura Line et al. 
Bachelorstuderende, University of Bristol, United Kingdom og Klinisk Mikrobiologisk Afdeling, Rigshospitalet, Danmark
Abstract, poster præsentation, 37th European Cystic Fibrosis Conference

Kronisk Pseudomonas aeruginosa lungeinfektion er en af den mest alvorlige komplikation ved cystisk fibrose. Infektionen er karakteriseret ved at Pseudomonas gror i uden ilt i biofilm i lungeslim. For at opklare hvordan Pseudomonas kan gro uden ilt, har vi fundet at fysiologiske mængder af nitrat gør dette muligt. Da vi tidligere har observeret denitrifikation i inficeret slim fra cystisk fibrose patienternes lunger, fandt vi at denitrifikation er aktiveret ved iltmangel og tilsætning af fysiologiske mængder af nitrat. Vi har således dokumenteret, at fysiologiske mængder af nitrat giver Pseudomonas bakterien mulighed for at gro i de iltfrie zoner i inficerede CF lunger, og vi foreslår, at denitrifikation bidrager til væksten.

Multicenter prevalence study of nontuberculous mycobacteria in patients with cystic fibrosis in Scandinavia

Af Tavs Qvist et al. 
Læge, Ph.D. studerende, Cystisk Fibrose Center København, Infektionsmedicinsk Afdeling, Rigshospiatlet 
Abstract, poster præsentation, 37th European Cystic Fibrosis Conference

Dette projekt ser på forekomsten af såkaldte non-tuberkuløse mycobakterier. Generelt beskrives forekomsten af disse bakterier at være stigende blandt patienter med cystisk fibrose, men der er store regionale forskelle. Forekomsten blandt skandinaviske cystisk fibrose patienter har hidtil ikke været afdækket. Dette projekt viser, at forekomsten af non-tuberkuløse mycobakterier også har været stigende i de skandinaviske lande fra 2000-2012 og 1 ud af 9 patienter har haft bakterierne i lungerne mindst én gang.

Lung Clearance index and Aspergillus colonization are clinical markers of chronic lung changes by spirometry controlled CT in children with Cystic Fibrosis

Af Thomas Kongstad et al.
Læge, Ph.D. studerende, Cystisk Fibrose Center København, Dansk BørneLungeCenter, Rigshospitalet
Abstract, poster præsentation, 37th European Cystic Fibrosis Conference

Dette abstract er første led i en artikel som danner hovedandelen af mit ph.d. projekt, der drejer sig om kortlægning af kroniske lungeforandringer hos børn med cystisk fibrose. Jeg har undersøgt 64 ud af 81 børn ml. 6-18 år som følges på CF centeret i Kbh. Min undersøgelsesmetode er såkaldt spirometrikontrolleret HRCT scanning af lungerne. Resultaterne er meget interessante ud fra et behandlersynspunkt, hvor opmærksomheden på Aspergillus (svampinfektion ) i lungerne har tendens til at drukne lidt i Pseudomonas og andre bakterier. Sammen med den nye lungefunktionsmålemetode Multiple-Breath Washout som over de sidste par år er implementeret i Cystisk Fibrose Centeret, er Aspergillus en parameter der hænger sammen med udbredelsen af kroniske lungeforandringer. Dette er ny viden, der kan få indflydelse på den behandling der skal gives i fremtiden.

Day-time variability and short term effect of chest physiotherapy on multiple breath nitrogen washout in children with cystic fibrosis

Af Kent Green (på vegne af Christian Volby) et al.
Læge, klinisk assistent, Cystisk Fibrose Center København, Dansk BørnelungeCenter, Rigshospitalet
Abstract, mundtlig præsentation, 37th European Cystic Fibrosis Conference

Studiet omhandler den relativt nye kliniske lungefunktionsmetode, Nitrogen Multiple-Breath Washout (N2 MBW), som er ved at blive implementeret i Cystisk Fibrose Center København med henblik på tidlig opsporing af forandringer i de helt små luftveje, og er en del af en række delstudie som har til formål at klarlægge N2 MBW teknikkens behandlingsmæssige potentiale og anvendelse. Resultaterne viser, at det ikke har nogen markant betydning på testens primære resultat, Lung Clearance Index eller blot LCI, hvornår på dagen N2 MBW undersøgelsen udføres eller om testen er forudgået af den daglige lungefysioterapi. Dette er ny og uhyre vigtig viden, idet man således ikke nødvendigvis skal tage højde herfor ved planlægning af forskningsstudier eller når metoden i den nærmeste fremtid bliver indført til skærpet overvågning af CF patienternes lungefunktion.

Can lung function predict exercise capacity in patients with CF?

Af Iben Østergaard Jensen et al.
Fysioterapeut, Fysioterapi- og Ergoterapiafdelingen, Aarhus Universitets Hospital Skejby
Abstract, poster præsentation, 37th European Cystic Fibrosis Conference

En lang række studier har tidligere fundet en sammenhæng mellem fysisk arbejdskapacitet og lungefunktion. Formålet med dette forskningsprojekt har været, at undersøge om der fandtes et lungefunktionsmål, der kunne forudsige fysisk arbejdskapacitet hos børn og voksne med cystisk fibrose. Projektet er baseret på registerdata af lungefunktion og iltoptagelse fra 78 patienter med cystisk fibrose i alderen 9-42 år. En model med at forudsige fysisk arbejdskapacitet alene ud fra lungefunktion blev ikke fundet anvendelig i praksis, da modellen var mere unøjagtig end hvad køn og alder kunne have forudsagt. Fysisk arbejdskapacitet skal derfor testes selvstændigt ved en iltoptagelsestest i stedet for at forudsiges ud fra lungefunktion. Resultatet af projektet er blandt andet, at man på Cystisk Fibrose Center Aarhus Universitetshospital Skejby fremover i praksis vil teste patienternes iltoptagelse med en ny og mere præcis metode, samt sætte fokus på at få alle patienter testet en gang om året.

Genome sequence of the Danish epidemic strain of Achromobacter ruhlandii

Af Kurt Handberg Jensen et al.
M.Sc. i Molekylærbiologi, Ph.D., Klinisk Mikrobiologisk Afdeling, Aarhus Universitetshospital Skejby
Abstract, poster præsentation, 37th European Cystic Fibrosis Conference

Bakterien Achromobacter xylosoxidans er kendt for at kunne spredes mellem patienter med cystisk fibrose ved krydsinfektion og er generelt forbundet med dårlig prognose. Dette projekt har afdækket forekomsten af en anden en bakteriestamme kaldet Achromobacter ruhlandii, der har spredt sig mellem patienter de to danske Cystisk Fibrose Centre i perioden 2000 til 2011. For at lære mere om årsagen til spredningen samt stammens resistens udvikling, er der foretaget en såkaldt genom sekventering af stammens DNA, som kan bruges til at bestemme om patienterne er smittet med bakterien ved krydsinfektion eller er inficeret med bakterien fra naturen/omgivelserne.

Outpatient parenteral antimicrobial therapy (OPAT) in patients with cystic fibrosis

Af Maya Graham Pedersen et al.
Stud.med, Infektionsmedicinsk Afdeling, Aarhus Universitetshospital Skejby
Abstract, poster præsentation, 37th European Cystic Fibrosis Conference

Cystisk fibrose patienter med kroniske bakterielle lungeinfektioner har stor glæde af at kunne få deres intravenøse antibiotika behandlinger som hjemmekur. Dette er dog ikke uden komplikationer. Dette projekt har registreret hyppigheden af komplikationer ved forskellige former for intravenøse adgange (drop, PICC-line og port-a-cath). Der er set en høj hyppighed for dropskift ved et såkaldt perifert drop (en kanyle i armen eller hånden) hvilken reduceres ved kontinuerlig indgivelse af medicin med en pumpe. Port-a-cath har den absolut laveste hyppighed af komplikationer, men når de opstår ved denne indgivelsesform, vil de typisk være af alvorligere karakter (infektion, blodprop).